В результате жизнедеятельности автотрофов образующийся примитивный почвенный покров постепенно обогащался синтезированными органическими .соединениями, и, следовательно, создавались предпосылки для размножения гетеротрофов. Так происходило увеличение видового состава микроорганизмов, положительно отразившееся на интенсивности почвообразовательного процесса. Необходимо подчеркнуть, что основную роль в его стимуляции сыграли азотфиксаторы, которые определили направление эволюции почв. Азотфиксирующие микроорганизмы явились своего рода "генетическим веществом", регулирующим последовательность и интенсивность энергомассообмена на отдельных этапах почвообразовательного процесса. Это утверждение, очевидно, справедливо не только для начальных фаз преобразования материнской породы, но и для зрелых почв. Более того, можно предположить, что значение биологической азотфиксации в почвах, подвергнутых антропогенному воздействию, возрастает и не может быть заменено внесением технического азота, который коренным образом изменяет пути превращения органического вещества.

Не менее важным для эволюционного развития почв, чем образование сложных органических соединений, явилось разрушение горных пород под воздействием живой материи. Как выяснилось, микрофлора, поселяющаяся на поверхности минералов, участвует в их деструкции. Сейчас известно несколько способов воздействия микроорганизмов на породы. Они могут подвергаться эрозии в результате выделения микрофлорой ферментов, проявляющих свои свойства по отношению к элементам, заключенным в кристаллические решетки. Биологическое разрушение минералов возможно и вследствие способности бактерий и водорослей к слизеобразованию. В состав слизей входят уроновые кислоты, которые, реагируя с частями кристаллических решеток, нарушают их целостность. Деструкция компонентов почвообразующей породы возможна и под воздействием других продуктов метаболизма микрофлоры. К ним относят органические и минеральные кислоты, а также биогенные щелочи [24].